После матушки Евфросинии с благословения старца Иосифа настоятельницей была назначена монахиня Екатерина. Происходившая из дворянского рода, она еще при жизни матушки Софии поступила в Шамординскую общину в возрасте сорока двух лет. Матушка Екатерина была преданной духовной дочерью преподобного Амвросия. Пройдя двадцатилетний путь монашеской жизни, она стала достойной преемницей своих наставниц – матушки Софии и матушки Евфросинии. Отец Иосиф был спокоен за обитель, вполне доверяя ведение всех дел и духовное воспитание сестер матушке Екатерине. Число сестер продолжало расти, и к 1908 году их насчитывалось более 700. Под молитвенным покровом почивших старцев и настоятельниц, под мудрым руководством старца Иосифа и матушки Екатерины и при неутомимых трудах благотворителей супругов Перловых, не жалеющих своих сил и средств на устроение, она продолжала расти и благоустраиваться: над кельями батюшки Амвросия был выстроен каменный футляр, заложена колокольня, выстроена усыпальница для настоятельниц. Но через семь лет настоятельства, 11 февраля 1911 года, матушка Екатерина отошла ко Господу, приняв перед смертью схиму.
